22 февраля 1995 года, определением Священного Синода Русской Православной церкви была возрождена монашеская жизнь в Тюменском Свято-Троицком мужском монастыре.
Тюменский Преображенский монастырь, известный сейчас как Свято-Троицкий, был основан в 1616 году пришедшим из Казанского Раифского монастыря монахом Нифонтом.
Обитель расположилась в живописном месте, на высоком мысу, омываемом с трех сторон водами реки Туры.
К 1624 году в Преображенском монастыре было несколько строений: кельи игумена и строителя, 6 братских келий, деревянная шатровая Спасо-Преображенская церковь. В это время число братии было всего три человека.
К 1680 году площадь и хозяйство монастыря значительно расширилось, Преображенской обители принадлежало 405,5 десятины пашни, 153 десятины залежной земли и 7550 копен сенных покосов. Количество братии возросло незначительно, поэтому все работы в приделах монастыря выполнялись зависимыми людьми всего около 200 человек: крестьянами, бобылями, трудниками.
С Тюменским мужским монастырем неразрывно связанно имя «Апостола Сибири» святителя Филофея митрополита Тобольского и всея Сибири чудотворца. В этой обители он провел большую часть своей жизни. Здесь, в тишине, он молился, читал и писал духовные произведения, занимался религиозно-просветительской работой.
Едва только вступив на Тобольскую кафедру в 1702 году, митрополит Филофей проезжая через Тюмень, увидел «обитель Преображения Господня опустошённую и приходящую в падеж падения». Деревянные кельи сильно обветшали, забор покосился, Преображенская церковь полуразрушена. Однако вид на Заречье отсюда открывался великолепный с обрывистого берега Туры. Возможно, после первого своего визита митрополит Филофей решает возродить монастырь как «Свято-Троицкий» в каменном исполнении.
В 1706 году святитель обращается к царю Петру I с просьбой разрешить строительство каменного собора подаянием мирских людей, а кирпич делать ссыльным людям. 14 декабря 1706 года в Тобольск была послана царская грамота с разрешением «на Тюмени в Спасовом монастыре построить церковь каменную».
Указом от 12 июня 1709 года император Петр повелел отпустить из Тобольской казны на строительство церкви тысячу рублей, кроме листового железа на крышу.
Теперь, когда Петром I была пожалована тысяча рублей, стало возможным использовать труд наемных рабочих. Постарался помочь митрополиту губернатор князь Гагарин, которых распорядился отправить стоить монастырь нескольких каменщиков и кирпичников из Верхотурья и Соли Камской. По распоряжению губернатора строительство обеспечивалось так же кузнецами и плотниками.
На седьмом году пребывания в Сибири святитель Филофей тяжко заболел. В 1709 году митрополит Филофей принимает схиму с именем Феодора и удаляется на покой в Троицкий Монастырь. До прибытия 14 августа 1711 года митрополита Тобольского Иоанна (Максимовича) управлял епархией из нашего монастыря.
Схимонах Феодор остается в обители, и строительство собора идет теперь под его непосредственным руководством. 9 декабря 1714 года вышел указ Петра I, запрещавший повсеместно в городах, кроме Санкт-Петербурга каменное строительство. Но в Тюменской обители строительство продолжалось.
Троицкий собор был освящен 16 июня 1715 года. Двухэтажный, пятиглавый Троицкий собор стал настоящей жемчужиной обители. Внутри храм украшен был великолепными иконостасами, блистающими позолотой и яркостью красок, в живописном стиле. Как видно из «Завещания», собор должен был иметь пять престолов: кроме главного Троицкого, второй – Успения Пресвятой Богородицы (в память его пострижения и воспитания в Киево-Печерской лавре); третий — в честь Преображения Господня (чтобы сохранить старое название монастыря в одном из его престолов); четвертый — на хорах, в память великомучеников Георгия Победоносца и Димитрия Солунского; пятый «южный» в честь преподобных отцов Антония и Феодосия Киево-Печерских. Предполагавшийся четвертый престол устроен не был.
Внутреннее убранство собора поражало своей красотою: храм был очень светлым, что в основном, не свойственно древним храмам. Великолепный пятиярусный резной иконостас блистал позолотой и яркостью красок. Все иконы в храме были написаны мастерами-монахами вызванными святителем Филофеем из Киева. Первый иконостас Троицкого собора просуществовал полтора столетия.
К северу от Троицкого собора в 1717 году была возведена трапезная, двуглавая церковь во имя Сорока мучеников Севастийских. В дальнейшем к храму были пристроен одноэтажный корпус для кухни и братских келий.
В западном столпе этого корпуса устроена домовая церковь митрополита Филофея в честь Боголюбской иконы Божией Матери, которую особо чтил святитель.
В 1721 году началось возведение каменной монастырской стены. В 1723 году, когда большинство каменщиков было взято по царскому указу на уральские заводы, строительство монастыря прекратилось.
По замыслу святителя Филофея, монастырь в свое время должен был быть еще один храм. Петропавловский храм Свято – Троицкого монастыря был заложен еще при жизни святителя у Южной стены в 1726 году.
Образцом для этого храма стала церковь на экономических вратах Киево – Печерской Лавры.
Весной 1727 года схимитрополит Феодор (Филофей) начал чувствовать приближение смерти и ожидал повелением Божия для отшествия в вечность. Перед смертью святитель сказал: «Похороните меня в Тюменской обители, вне церкви, на пути, дабы мимоходящие попирали ногами прах мой, обуявшую соль земли». 31 мая 1727 года архипастырь почил кротким сном праведника в Троицкой обители на 77 году от рождения.
Окончательно обитель была отстроена уже после смерти митрополита Филофея. Каменное строительство Троицкого монастыря было возобновлено только с 1733 года, когда игумена Гедеона сменил архимандрит Зиновий.
В 1739 году была достроена каменная монастырская стена. В этом же году в 77 метрах от Троицкого собора были возведены каменные настоятельские покой. Они состояли из трех частей: сеней и двух палат по краям. У главного входа находилось утраченное позднее крыльцо под деревянной крышей с внутренней лестницей, ведущей на второй этаж. Настоятельские покой стали первым жилым каменным зданием в Тюмени.
В 1830 году архимандрит Амвросий устроил каменное надгробие с изображением креста, лика святителя и с надписью, а над всем – небольшой навес из листового железа.
В 1842 году в Тюмени случился большой пожар, уничтоживший возле монастыря около 200 домов. Петропавловская церковь пострадала так, что кроме каменных стен ничего не осталось. Настоятель монастыря Архимандрит Владимир на пожертвования благотворителей сделал капитальный ремонт не только Петропавловской церкви, но и Троицкого собора.
В 1885 году при архимандрите Филарете (Кожевникове) был построен деревянный корпус, в котором разместились кухня, братский корпус, хлебный амбар и погреб.
В 1890 году Мученическая церковь, стоявшая более пятидесяти лет без Богослужений, была отремонтирована на средства А.Ф. Смагина. Обе главы были покрашены и вызолочены оба креста. Из прежнего иконостаса иконы были вставлены в новый, простой работы, и подвинули престол несколько ближе восточной части алтаря. Освящение храма совершил епископ Иустин (Полянский).
300 – летие основания Троицкой обители – совпало по времени с трудными годами для России годами Первой Мировой войны.
Уже с начала войны монастырь начинает регулярно отчислять пожертвования в пользу больных и раненных. Когда в Тюмени появились первые увеченные солдаты с передовой, Троицкий монастырь дал согласие приютить увеченных воинов. В резолюции Его Преосвященства от 30 мая 1915 года, де утверждается это решение, игумен Мариниан был назван человеком редкой доброты, который рад будет принять защитников Родины.
Нужно заметить, что Троицкий монастырь во время Отечественной войны 1812 года также отчислял средства «на нужды войны».
С приходом к власти большевиков в 1917 году, начинается сложный период в истории Свято-Троицкого монастыря.
В фондах Тобольского архива сохранился документ, который сообщает сведения о последнем наместнике Троицкого монастыря. В этом письме говориться, что по благословению Патриарха Тихона, Священный Синод слушал представление архиепископа Николая от 27 марта 1922 года и ходатайствовал о пострижении в монашество и возведение в сан архимандрита протоиерея Вознесенской церкви Александра Коровина, перемещенного на должность наместника Троицкого монастыря.
В июне 1922 года после ареста настоятеля монастыря викарного епископа Иринарха (Синекова-Андриевского) архимандрит Серафим (Коровин) был назначен наместников Троицкого монастыря.
Свято-Троицкий монастырь был закрыт 11 августа 1923 года. Церковный совет подвергся аресту. В его состав входили: архимандрит Серафим (Коровин), священнослужители Вениамин (Поповский), Палладий (Красильников), Антоний (шутов), Алексий (Воронов), Дамиан (Прокопьев), Герасим (Муравьев), Авель (Панасенко), и звонарь Илия Преображенский.
Уже в первой половине сентября монастырь был фактически разграблен. Изымалось все: от митр и посохов (среди которых были и принадлежавшие некогда митрополиту Филофею) до последней лампочки, табуретки и даже полотенца.
В 1924 году монастырские здания, как памятники зодчества, были переданы отделу Главнауки, там расположился музей атеизма. Поскольку у музея не было средств, что бы заняться ремонтными работами, в 1925 году заведующий секцией музеев и охраны памятников Л.Р. Шульц предложил вернуть Троицкий собор группе верующих, но в этом было отказано. Настоятельские покой передали в аренду санаторию для туберкулезных детей, церковь Петра и Павла – окархиву, а в церкви Сорока мучеников расположили автохранилище.
Несмотря на происходящие в стенах обители перемены, бывшие прихожане Троицкого монастыря, не теряли надежды на возобновление в нем богослужений. В 1925 году они образовали общину Свято-Троицкого соборного храма, названную Свято-Троицким Затюменским религиозным обществом, состоящим из 257 человек, и утвердили устав, зарегистрированный в окружном административном отделе.
На заявления уполномоченных общины о проведении богослужения в Троицком соборе и о передачи ее в пользование предметов церковной утвари, последовал отказ краевого административного отдела.
В 1941 году Троицкий монастырь был передан коммунально-эксплуатационной части военного гарнизона г. Тюмени
В 1946 году было принято решение о строительстве Горводоканала. Тогда было принято решение о строительстве на территории Троицкого монастыря очистных сооружений. Церковь в честь сорока мучеников Севастийских и домовая церковь митрополита Филофея в честь Боголюбской иконы Божией Матери были снесены.
В январе 1946 года областной совет принял решение о сохранении памятников древнерусской архитектуры бывшего Троицкого монастыря: «… Изъять в ведения ЕЭЧ Тюменского гарнизона временно переоборудовавшийся им на время Великой Отечественной войны под вещевые склады все здания и сооружения бывшего Троицкого монастыря г. Тюмени». Далее в этом документе говориться о запрещении КЭЧ дальнейшего использования здании Троицкого монастыря и передаче его в ведение областного отдела по делам архитектуры до 1 февраля 1946.
В 1947 году выходит постановление Совета Министров РСФСР от 21 мая за № 389 «Об охране памятников», которые находятся под охраной государства. К нам были отнесены Тобольский кремль и Тюменский Троицкий монастырь.
Но в 1957 года КЭЧ Тюменского гарнизона продолжал занимать территорию монастыря. По этому вопросу было принято решение «О ремонте и реставрации архитектурного памятника бывшего Троицкого монастыря». Облсовет решил: предложить областному управлению культуры расторгнуть в установленном порядке арендный двор на использование КЭЧ Тюменского гарнизона бывшего Троицкого монастыря в г. Тюмени и предложить КЭЧ к 1 августа 1958 года освободить все помещения для реставрации и организации музея.
22 июня 1994 года Свято-Троицкую обитель посетил Святейший Патриарх Московский и всея Руси Алексий II. Монастырь тогда не был передан епархии, и на его территории располагался Горводоканал, в Петропавловском храме расположился филиал областного краеведческого музея, в наместническом корпусе – Госрегестрация.
22 февраля 1995 года Священный Синод постановил возродить монашескую жизнь в Тюменском Троицком мужском монастыре. Решением Священного Синода, исполняющим обязанности наместника Свято – Троицкого мужского монастыря был назначен преподаватель Тобольской Духовной семинарии иеромонах Тихон (Бобов). 5 мая 1995 года к Троицкому монастырю был приписан Крестовоздвиженский храм. Поскольку монастырские храмы еще не переданы епархии, то наместник жил и служил в Крестовоздвиженском храме.
2 сентября 1995 года Троицкий собор посетили епископ Василий (Родзянко) (+1999) и епископ Тобольский и Тюменский Димитрий. Епископ Василий выразил уверенность, что Троицкий собор еще возродится в былом великолепии.
10 декабря 1996 года состоялась передача Троицкого монастыря Тобольско-Тюменской Епархии. В акте передачи принимали участие: епископ Тобольский и Тюменский Димитрий, министр культуры Е.Ю. Сидоров, заместитель губернатора Тюменской области Ю.М. Конев, братия обители и хор Тобольской Духовной семинарии.
Указом Святейшего Патриарха Московского и всея Руси Алексия II за труды по возрождению обители наместник монастыря игумен Тихон (Бобов), удостоен ордена благоверного князя Даниила Московского III степени.
20 июня 1998 года на восстановленную колокольню Крестовоздвиженского храма подняли купол с крестом. В этот день в здании Тюменского Духовного училища с участием епископа Тобольского и Тюменского Димитрия и епископа Хабаровского Марка проходила конференция «Сибирь Молодая Православная» на которой присутствовали священники и молодежь северных и южных приходов епархии.
31 августа 1998 года Святейший Патриарх Алексий II прибыл в город Тюмень. После посещения Знаменского собора Святейший Патриарх посетил Крестовоздвиженский храм, где был встречен священством монастыря.
19 июля 1999 года на заседании Священного Синода благословлено открыть Духовное училище с 3-летним сроком обучения.
30 июля 2000 года архиепископ Тобольский и Тюменский Димитрий освятил новый Братский корпус обители.
28 августа 2001 года в Успенском приделе Троицкого собора была совершена первая Божественная Литургия после закрытия монастыря.
15 июня 2003 года в Троицком соборе было совершено первое после 80 – летнего перерыва Богослужение, которое возглавил архиепископ Тобольский и Тюменский Димиртий. Указом Святейшего Патриарха Московского и всея Руси Алексия II наместник монастыря игумен Тихон (Бобов) за Божественной литургией возведен в сан архимандрита. По окончании Богослужения на соборной площади монастыря был совершен молебен с освящением колоколов.
4 августа 2003 года было выявлено место захоронения честных останков митрополита Тобольского Филофея
19 августа 2003 года после Божественной Литургии губернатор Тюменской области С.С. Собянин вручил ключи от Петропавловского храма архиепископу Тобольскому и Тюменскому Димитрию. В ноябре этого же года началась реставрация Петропавловского храма.
22 марта 2004 года после вечернего правила состоялось первое монашеское собрание братии монастыря. Рассматривался вопрос о приятии устава обители, монастырском богослужении, братском хоре, чине Панагии, о благопристойном поведении и благоустройстве территории.
В декабре 2005 года был закончен монтаж куполов Троицкого собора и реставрация первого ряда фресок центрального нефа.
15 апреля 2005 года состоялся мантийный постриг иеромонаха Амвросия (Голованя) с оставлением прежнего имени в честь преподобного Амвросия Оптинского и инока Гурия с наречением имени в честь преподобного Германа Валаамского.
4 сентября 2005 года свято-Троицкий монастырь посетили архиереи, прибывшие на торжества по случаю обретения мощей Священномученика Гермогена епископа Тобольского: митрополит Чебоксарский и Чувашский Варнава, архиепископ Тобольский и Тюменский Димиртий, архиепископ Красноярский и Енисейский Антоний, епископа Абаканский и Кызылский Ионафан, епископ Барнаульский и Алтайский Максим. В дар монастырю была передана икона Священномученика Гермогена епископа Тобольского с частицей его мощей.
13 сентября 2005 года закончены работы по монтажу новых куполов Петропавловского храма.
25 апреля 2006 года архиепископ Тобольский и Тюменский Димитрий освятил новый корпус Тюменского Духовного училища на улице Димитрова. 3.
21 октября 2006 года в Свято-Троицкий мужской монастырь из Вознесенско — Георгиевского храма были перенесены мощи святителя Филофея митрополита Тобольского и всея Сибири чудотворца.
4 – 5 сентября 2012 года в Свято-Троицком монастыре прибывали мощи Великомученика Димитрия Солунского.
Делегацию из Греции встречали архиепископ Тобольский и Тюменский Димитрий, первый заместитель Губернатора Н.А. Шевчик, наместник Свято-Троицкого мужского монастыря архимандрит Тихон, хор Духовного училища, священство Тюменского благочиния.
3-4 ноября 2012 года в Тюмени пребывала величайшая святыня – Пояс Пресвятой Богородицы.По прибытии в Тюмень в аэропорту «Рощино» был отслужен молебен. Далее Пояс Богородицы отправился в Благовещенский собор, где был отслужен молебен. По центральным улицам города до Свято-Троицкого мужского монастыря прошел Крестный ход. В Троицком соборе Пояс Пресвятой Богородицы простоял до раннего утра 4 ноября. В течение суток Поясу Пресвятой Богородицы смогли поклониться около 40 тысяч человек.
2 октября 2013 года Священный синод образовал в приделах Тюменской области Тобольскую митрополию включавшую в себя Тобольскую и Ишимскую епархию. Определением Священного Синода епископом Ишимским и Аромашвским избран наместник Свято – Троицкого мужского монастыря архимандрит Тихон (Бобов). 3 ноября 2013 года архимандрит Тихон Был хиротонисан во епископа Ишимского и Архмашевского.
Указом Святейшего Патриарха Московского и всея Руси Кирилла от 10 сентября 2014 года епископ Тихон освобожден от должности ректора Тюменского Православного Духовного училища.
Решением Священного Синода от 23 октября 2014 года епископ Тихон был освобожден от должности наместника Свято — Троицкого монастыря.
8 ноября 2014 года состоялся мантийный постриг иеродиакона Никона (Ильсибакова) в честь преподобного Никона Радонежского и инока Нифонта (Максимова) с нареченным именем в честь преподобного Савватия Соловецкого.
9 ноября 2014 г. наместником Свято-Троицкого мужского монастыря был избран иеромонах Михей (Селяков).
10 декабря 2014г. в Знаменском соборе Абалакского мужского монастыря митрополит Тобольский и Тюменский Димитрий совершил иерейскую хиротонию насельника монастыря иеродиакона Никона (Ильсибакова) и диаконскую хиротонию монаха Нифонта (Максимова).
Оглядываясь на путь, пройденный в древней обителью в веках, нельзя отметить, что на протяжений столетий наблюдается преемственность тех установлений и того рода деятельности, которые возникли в ее стенах при митрополите Филофее.
Тюменский Свято – Троицкий монастырь – это общежительная обитель, которая непосредственно подчиняется митрополиту Тобольскому и Тюменскому Димитрию, который является священноархимандритом Свято – Троицкой обители.
Обычный день в обители начинается в 5,30 утра. В 6 часов в Троицком соборе у мощей святителя Филофея начинается утреннее монашеское правило: полунощница, утренние молитвы, чтение Евангелия, Апостола и поучений Святых отцов.
В 8.00 начинается утреня с Божественной Литургией, в 17.00 вечернее богослужение.
Священнослужители регулярно посещают медицинские учреждения Тюмени: онкодиспансер, хоспис, туберкулезный изолятор для детей, где исповедуют причащают, крестят и соборуют больных, а так же бывают и исправительных учреждениях ГУИН, проводят беседы с осужденными и совершают требы
Жизнь не стоит на месте, и процесс духовного обновления набирает силу. Возрождается молитвами святителя Филофея обитель Свято Троицы, обретают веру молодые люди, получают духовное воспитание и образование в ее стенах под покровом сибирского святителя. И теперь, присутствуя здесь своими мощами, праведный архипастырь, не оставляет никого, приходящего к нему, неутешенным, как во время своей жизни земной не оставлял своих современников.